五个结合，创新高校绿化设计理念。闵行校区是上海交通大学发展和实现建设世界一流大学的主要办学基地。校园绿化规划之初，学校有关部门组织专家反复研讨，多次论证最优化、最生态化设计方案，充分利用校区内三横一纵四河四湖的天然水系优势，形成了“五个结合”的创新绿化思路，即注重观花植物与观叶植物有机结合；注重乔木、花灌木、地被植物有机结合；注重落叶植物与常绿植物有机结合；注重植被多样性与新品优品种有机结合；注重环境友好型植物与植被代谢物循环再生有机结合。多视角、多渠道、多手段打造一流大学绿化体系，从视觉、听觉、触觉、嗅觉，多种感官视角合力营建“宜人校园”。

　　“四有”机制，提升校园绿化内涵。大自然是人类获得灵感，探寻真意的起点。为全面搭建启迪心灵、提升灵魂的外部自然环境，上海交通大学推行“四有”――有组织、有队伍、有风气、有实效，作为体制与机制保障，确保绿化工作从外延拓展向内涵建设转变，从朝夕种植向心灵播种转变，从简单劳作向实践育人转变。近年来，学校实施“绿化内涵提升计划”，在现有绿化基础上打造桃柳环、校友纪念林、水杉林、木兰园、梅花海棠园、桂花园、荷塘等十大主题园林。学校也因此荣获“全国部门造林绿化400佳单位”、“全国绿化先进集体”、 “上海市花园单位”、上海市绿化工程“园林杯”、上海市高校世博景点评比一等奖等各类奖项30余项。
　　三位一体，建设校内植物标本园。2011年4月，在教育部和农业部的支持下，占地面积55,000平方米的闵行校区植物标本园落成，是全国屈指可数的校内植物园。植物标本园集“教学、科研、休闲”三位一体，不仅可为农业生物类相关专业的学生提供良好的学习实践场所，也为园林、园艺、植物、生物、药学、环境等相关学科提供了良好的公共科研平台。同时，植物园为全校师生营建了一个休憩的空间，实现绿色休读、创意休读。目前，植物标本园已收集近千种植物资源，包括国家15种一级保护树种中的5种，国家38种二级保护树种中的20种，成为一个浓缩的“植物王国”，在这个“植物王国”里，阡陌交通，因势利导，收放自如，俨然一副桃源美景图。